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Begriffe, Krankheiten, Einrichtungen u.v.m., verknüpft mit dem zuständigen Bereich.
Im Menüpunkt "Übersicht" sind Einrichtungen unter verschiedenen Gesichtspunkten gruppiert: Kliniken, Abteilungen, Institute, Zentrale Einrichtungen und ähnliches.
Leitung:
Prof. Dr. Daniel Jonas
Tel.: ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 73 / 82 88
Fax: ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 03 / 82 83
E-Mail: daniel.jonas@uniklinik-freiburg.de
MitarbeiterInnen
Dr. rer. nat. Klaus Biehler
Tel. ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 88
E-Mail: klaus.biehler@uniklinik-freiburg.de
Frau Sabine Kaiser (MTA)Tel. ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 89
Tel. ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 89
E-Mail: sabine.kaiser@uniklinik-freiburg.de
Frau Doris Rein-Hartung (MTA)
Tel. ++49 (0) 7 61 / 2 70 - 82 89
E-Mail: doris.rein-hartung@uniklinik-freiburg.de
Molekularlabor
Aufgabengebiet ist die molekulare Epidemiologie von nosokomialen Infektionserregern und ihren Antibiotika-Resistenzgenen. Das Labor unterstützt die Krankenhaushygiene bei der Aufklärung von vermuteten Übertragungsereignissen und Ausbrüchen.
Typsierungskosten für auswärtige Einsender werden auf Anfrage mitgeteilt.
Einsendeprotokoll (PDF-Dokument)
S. maltophilia Multilocus Sequence Typing Database
Typisierungsverfahren sind für folgende Erreger vorhanden:
Staphylococcus aureus, Enterococcus faecium, Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp., Serratia marcescens, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter spp., Legionella pneumophila.
Verfügbare Typisierungsmethoden sind:
Makrorestriktionsanalyse (PFGE), Amplified fragment length polymorphism (AFLP), Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD), Multiple Locus Variant Numbers of Tandem Repeat Analysis (MLVA), spa Typisierung, Multi Locus Sequence Typing (MLST).
Identifizierung von Antibiotikaresistenzgenen
Sequenz-basierte Identifizierung von beta-Laktamase-kodierenden DNA-Sequenzen:
- Extended Spektrum beta-Laktamasen (Gruppen TEM, SHV, CTX-M, OXA)
- Metallo-beta-Laktamasen (Gruppen IMP, VIM, GIM, SPM, SIM)
- Carbapenemasen (Gruppen NMC, IRS, IMI, KPC, GES)
- AmpC beta-Laktamasen (Gruppen MOX, CMY, LAT-4, BIL-1, DHA, ACC, MIR-1T, ACT-1, FOX)
- Quinolonresistenzgene (gyrA, parC, qnr)
- Gram-positive Resistenzgene: mecA, SCCmec, vanA, vanB, MLS-Gruppe (ermA, ermC, msrA)
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Arbeitsschwerpunkte:
Forschungsschwerpunkte sind die überregionale Verbreitung von multiresistenten bakteriellen Erregern und Antibiotika-Resistenzgenen, wie z.B. beta-Laktamasen, sowie deren Einordnung in genetisch sinnvolle Gruppen.
Von weiterem Interesse ist die genetische Verwandtschaft von nosokomialen Infektionserrregern mit Bakterienpopulationen in der Umwelt außerhalb von Krankenhäusern.
Wichtige Links (PDF-Dokument)
Journal Club
- Genodiversity of resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in relation to antimicrobial usage density and resistance rates in intensive care units. Infect Control Hosp Epidemiol. 2008; 29:350
- Potential associations between hematogenous complications and bacterial genotype in Staphylococcus aureus infection. J Infect Dis. 2007;196:738
- Extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-1 in Escherichia coli isolates from healthy poultry in France. Appl Environ Microbiol. 2007; 73:4681
- Molecular analysis of human forearm superficial skin bacterial biota. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007; 104:2927
- Establishing clonal relationships between VIM-1-like metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa strains from four European countries by multilocus sequence typing. J Clin Microbiol. 2006; 44:4309
