Die Abteilung Sportmedizin ist per Kooperation verbunden mit

• der Sporttraumatologie der Uniklinik Freiburg (im selben Haus)
• dem Olympiastützpunkt Freiburg (Herr U. Wiedmann)
• "Die SportOrthopäden" Praxisklinik an den Heilquellen
• dem Radlabor im Institut für Sportwissenschaften
• dem Institut für Sport und Sportwissenschaft Freiburg (Prof. Dr. A. Gollhofer)
• der Abteilung Pneumologie der Medizinischen Uniklinik Freiburg (Prof. S. Sorichter, Prof. J. Müller-Quernheim)
• der Arbeitsgruppe "Atemmuskelkraft, Lungenfunktion und Spiroergometrie" von Dr. Achim Kabitz und Prof. Wolfram Windisch in der Abteilung Pneumologie der Medizinischen Uniklinik Freiburg
• der Abteilung Experimentelle Anästhesie der Uniklinik Freiburg, Forschungsgruppe Klinische Atemphysiologie (Prof. J. Gutmann, Dr. C. Stahl, Dr. S. Schumann)
• dem "Ärztenetz Adipositas"
• dem Arbeitsbereich Ernährung am Institut für Sportwissenschaften der Universität Freiburg
• der Russian Academy of Sciences, Institute of Mathematical Problems of Biology, Laboratory of Macromolecular Crystallography, Pushchino (Prof. V.Y. Lunin)
• der Universität Konstanz, Fachbereich Biologie, Molecular Bioinformatics (Prof. K. Diederichs)