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Tumorzentrum Freiburg - CCCF

Arbeitsgemeinschaft Biobanken & Genomics

Die Arbeitsgemeinschaft Biobanken & Genomics konstituierte sich 2013. Die fachliche Leitung hat Professor Martin Werner. Die AG hat folgende Schwerpunkte:

Die AG Biobank hat sich die Aufgabe gestellt klinische Daten, experimentelle Daten und pathologische Daten in der onkologischen Forschung zu verknüpfen. Die AG greift dabei auf die Expertise des Instituts für Klinische Pathologie, des Instituts für Molekulare Medizin und Zellforschung, des CCI, des Instituts für Medizinische Biometrie und Statistik und klinischer Fachabteilungen zurück. Die Bioinformatik wird hierbei z.B. in Next Generation Sequencing (NGS) Projekte integriert, die Transkriptom Analysen, Exome Sequenzierungen oder Whole Genome Sequenzierungen durchführen. Die AG Mitglieder ermitteln den Bedarf an NGS am CCCF, setzen entsprechende Projekte um und entwickeln Sequenzierungsprotokolle. Ziel ist es unter anderem die Analyseergebnisse mit klinischen Endpunkten abzugleichen, Erkenntnisse in Modelle umzusetzen und die Möglichkeiten einer Übertragung in ein Tiermodell und in die klinische Erprobung zu prüfen.

Die AG hat das Ziel die Erfassung der Tumorentitäten am Standort Freiburg in der Biobank  zu komplettieren.  

Die AG treibt außerdem die Bestrebungen voran, eine Harmonisierung des Biobankings zu erreichen und die Weiterentwicklung von webgestützten Biobanking Portalen zu forcieren. Diese wichtige Thematik kommt insbesondere in der Beteiligung am Deutschen Konsortium Translationaler Krebsforschung (DKTK) zum Tragen, in dem die Erfassung und der Austausch von Biobank Daten insbesondere unter Anwendung von Sequenzierungsmethoden eine wichtige Rolle spielen.

 

Die AG Biobanken und Genomics trifft sich in einem Turnus von 3-4 Monaten.  

Mitglieder:

Prof. Dr. Martin Werner (Klinische Pathologie)

Dr. Peter Bronsert (Klinische Pathologie)

Prof. Dr. Silke Laßmann (Klinische Pathologie)

Prof. Dr. Christoph Peters (CCCF)

Prof. Dr. Lena Illert (Med I)

Prof. Dr. Martin Boeker (IMBI)

PD Dr. Alexandra Nieters (CCI)

Dr. Dr. Melanie Börries (IMMZ)


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