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Institut für Infektionsprävention und Krankenhaushygiene

Leistungskatalog des Hygiene- und Molekularlabors

Der Leistungskatalog ist hier hinterlegt.

Im Hygiene- und Molekularlabor sind  einzelne Prüfverfahren nach DIN EN ISO/IEC 17025 akkreditiert.

Informationen hierzu können Sie der Datenbank der DAkkS entnehmen. Die Akkreditierung gilt für die in der Urkunde aufgeführten Prüfverfahren: Akkreditierungsurkunde D-PL-13134-03-00

Zu Fragen von Probenahme und Probeversand stehen wir zur Verfügung.

Genotypisierungen

  • Staphylococcus aureus (PFGE, spa, MLST/SBT)
  • Enterococcus faecium (MLVA, MLST/SBT)
  • Escherichia coli (AFLP)
  • Klebsiella spp. (AFLP)
  • Enterobacter spp. (AFLP)
  • Serratia marcescens (AFLP)
  • Pseudomonas aeruginosa (AFLP, MLVA, MLST/STB)
  • Stenotrophomonas maltophilia (AFLP, MLST/STB)
  • Acinetobacter spp. (AFLP)
  • Legionella pneumophila (AFLP, MLST/SBT)
  • Clostridium difficile (Ribotypisierung)

(PFGE: Pulsfeld-Gelelektrophorese; spa: Staphylococcal Protein A Typing; AFLP: Amplified Fragment Length Polymorphism; MLVA: Multiple Locus Variant Number of Tandem Repeat Analysis, MLST: Multi Locus Sequence Typing; SBT: Sequence based Typing)

Einsendeformular (rft-Dokument)

Identifizierung von Antibiotikaresistenzgenen

  • Sequenz-basierte Identifizierung von ß-Laktamase-kodierenden Sequenzen: Extended Spektrum beta-Laktamasen (Gruppen TEM, SHV, CTX-M, OXA), Metallo-beta-Laktamasen (Gruppen IMP, VIM, GIM, SPM, SIM), Carbapenemasen (Gruppen NDM, NMC, IRS, IMI, KPC, GES) sowie AmpC.
  • Gram-positive Resistenzgene: mecA, SCCmec, vanA, vanB, MLS-Gruppe (ErmA, ErmC, msrA)
  • Quinolonresistenzgene (gyrA, parC, qnr)

Bakterienidentifizierung

  • Identifizierung von Bakterien aus Reinkulturen mittels MALDI-TOF Massenspektrometrie
  • Biochemisch (API)
  • Molekularbiologisch (16S rRNA, cpn60, gyrB, mip bei Legionella spp.)
  • Virulenzfaktoren: S. aureus: Panton Valentin Leukozidin; Arraymate microarrays E. coli: Aerobactin iutA und Yersiniabactin fyuA, Kapsel Synthese Genlocus kpsMT II, Invasivfaktor ibeA, Serumresistenzfaktor traT, Adhäsionsfaktoren papA und papG, iron-regulated gene homologue adhesin iha; Bestimmung der phylogenetischen Gruppe.

Resistenztestung gegenüber Antibiotika u.a. Naturstoffen

  • Mikro- oder Makrodilutions-Bouillon-Verfahren (CLSI)
  • Agardiffusion (CLSI, DIN), E-Test (auf Anfrage)
  • Bakterizidietestung (CLSI)
  • Synergismus-Testung (Chekerboard -Methode)

Prüfung auf Sterilität

  • Membranfiltermethode (Ph. Eur.)
  • Direktbeschickungsmethode (Ph. Eur.)

 

Stammsammlung

Abgabe von charakterisierten (genotypisierten) Stammsammlungen:

  • Staphylococcus aureus
  • Enterococcus faecium
  • Escherichia coli
  • Klebsiella spp.
  • Enterobacter spp.
  • Serratia marcescens
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Stenotrophomonas maltophilia
  • Acinetobacter spp.
  • Legionella spp.)

Angewandte Methoden

Typisierungsverfahren sind für folgende Erreger vorhanden:

  • Staphylococcus aureus
  • Enterococcus faecium
  • Escherichia coli
  • Klebsiella spp.
  • Enterobacter spp.
  • Serratia marcescens
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Stenotrophomonas maltophilia
  • Acinetobacter spp.
  • Legionella pneumophila
  • Clostridium difficile

Verfügbare Typisierungsmethoden sind:

  • Makrorestriktionsanalyse (PFGE)
  • Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)
  • Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD)
  • Multiple Locus Variant Numbers of Tandem Repeat Analysis (MLVA)
  • spa Typisierung
  • Multi Locus Sequence Typing (MLST)
  • Arraymate microarray Untersuchungen

Identifizierung von Antibiotikaresistenzgenen
Identifizierung von beta-Laktamase-kodierenden DNA-Sequenzen durch Sequenzieren und RT-PCR:

  • Extended Spektrum beta-Laktamasen (Gruppen TEM, SHV, CTX-M, OXA)
  • Metallo-beta-Laktamasen (Gruppen IMP, VIM, GIM, SPM, SIM)
  • Carbapenemasen (Gruppen NDM, NMC, IRS, IMI, KPC, GES)
  • AmpC beta-Laktamasen (Gruppen MOX, CMY, LAT-4, BIL-1, DHA, ACC, MIR-1T, ACT-1, FOX)
  • OXA beta-Laktamasen
  • Quinolonresistenzgene (gyrA, parC, qnr)
  • Gram-positive Resistenzgene: mecA, SCCmec, vanA, vanB, MLS-Gruppe (ermA, ermC, msrA

(Cluster-) Analysen von Typisierungsdaten:

  • BioNumerics
  • Mega
  • Splitstree
  • Phylogenetic analysis using Parsimony (PAUP)
  • Recombination Detection Program
  • Staden package
  • Ridom Staphtype

Leistungen werden gegebenenfalls an kompetente Unterauftragnehmer vergeben. 

 

Leitung:

OA Prof. Dr. Daniel Jonas


Telefon: +49 (0) 761 270-82730 / 82880
Fax      : +49 (0) 761 270-82030 / 82830
daniel.jonas@uniklinik-freiburg.de