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Klinik für Innere Medizin IHämatologie, Onkologie und Stammzelltransplantation

M.D. and Ph.D. students

 

Wir suchen:

Studentinnen und Studenten der Molekularen Medizin, Medizin, Humanbiologie, Bioinformatik, Biochemie oder Biologie

Wir bieten:

  • Fachliche und Individuelle Betreuung
  • Eigenständige Projekte
  • Ein breites Methodenspektrum aus den Bereichen der Molekularbiologie, Biochemie und Hämatologie/Onkologie
  • Kollegiales Team

Die Betreuung erfolgt direkt durch Herrn Dr. C. Miething.

Für weitere Informationen stehen wir gerne zur Verfügung.

Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der Genom-Analyse von Tumoren sowie mit funktionellen genetischen Screens zur Identifikation von neuen Zielstrukturen in der Krebstherapie.

Dr. med.univ. Khalid Shoumariyeh
Arzt

khalid.shoumariyeh@uniklinik-freiburg.de

Desiree Schneider
Molekular-Medizinische Doktorandin

Desiree.Schneider@uniklinik-freiburg.de

Sophia Ehrenfeld
Molekular-Medizinische Doktorandin

Sophia.Ehrenfeld@uniklinik-freiburg.de

Pia Veratti
Technische Assistentin

pia.veratti@uniklinik-freiburg.de

Jessica Beckert
Technische Assistentin

jessica.beckert@uniklinik-freiburg.de

Schematische Darstellung der miRNA-Prozessierung. Endogene miRNAs und durch virale Vektoren in die genomische DNA (gDNA) eingeschleusste miRNA-basierte shRNAs werden von PolII-Promotoren als pri-miRNA exprimiert. Nach Prozessierung durch Drosha/DGCR8 wird die pre-miRNA mit Hilfe von Exportin5 (Exp5) in das Zytoplasma transferiert. Hier wird die pre-miRNA durch weitere Nukleasen (Dicer) zu einem RNA-Duplex verarbeitet, das zusammen mit u.a. Argonaute Nukleasen (Ago2) den RISC-Komplex zur Degradierung von Target-mRNAs bildet.

DKTK Joint Funding: Novel tools for dissection of oncogenic pathways

RNA-Interferenz (RNAi) ist ein vor wenigen Jahren entdeckter Mechanismus, der die Möglichkeit bietet, die Expression eines jeden einzelnen Gens gezielt still zu legen. Durch sequenzspezifischen Abbau einer ausgewählten mRNA-Population in der Zelle wird die Synthese eines Proteins verhindert. Das Novel Tools Projekt sieht vor, RNA Interferenz Bibliotheken und Genom modifizierende Technologien für das Screening der häufigsten Krebsentitäten und der Mikroumgebung der als kritisch angesehenen Gene zu entwickeln.  Letztere sollen durch die Verwendung von neuen Methoden des Genome-Editing (Zinc Finger Nucleasen, TALEN und CRISPR) und „small hairpin RNA“ (shRNA)-transgenen Mäusen validiert werden.

  • DKFZ Heidelberg

  1. Acquired dependence of acute myeloid leukemia on the DEAD-box RNA helicase DDX5.
    Mazurek A, Park Y, Miething C, Wilkinson JE, Gillis J, Lowe SW, Vakoc CR, Stillman B.
    Cell Rep. 2014 Jun 26;7(6):1887-99. doi: 10.1016/j.celrep.2014.05.019. Epub 2014 Jun 5.

  2. PTEN action in leukaemia dictated by the tissue microenvironment.
    Miething C, Scuoppo C, Bosbach B, Appelmann I, Nakitandwe J, Ma J, Wu G, Lintault L, Auer M, Premsrirut PK, Teruya-Feldstein J, Hicks J, Benveniste H, Speicher MR, Downing JR, Lowe SW.
    Nature. 2014 Jun 19;510(7505):402-6. doi: 10.1038/nature13239. Epub 2014 May 4.

  3. A recurrent germline PAX5 mutation confers susceptibility to pre-B cell acute lymphoblastic leukemia.
    Shah S, Schrader KA, Waanders E, Timms AE, Vijai J, Miething C, Wechsler J, Yang J, Hayes J, Klein RJ, Zhang J, Wei L, Wu G, Rusch M, Nagahawatte P, Ma J, Chen SC, Song G, Cheng J, Meyers P, Bhojwani D, Jhanwar S, Maslak P, Fleisher M, Littman J, Offit L, Rau-Murthy R, Fleischut MH, Corines M, Murali R, Gao X, Manschreck C, Kitzing T, Murty VV, Raimondi SC, Kuiper RP, Simons A, Schiffman JD, Onel K, Plon SE, Wheeler DA, Ritter D, Ziegler DS, Tucker K, Sutton R, Chenevix-Trench G, Li J, Huntsman DG, Hansford S, Senz J, Walsh T, Lee M, Hahn CN, Roberts KG, King MC, Lo SM, Levine RL, Viale A, Socci ND, Nathanson KL, Scott HS, Daly M, Lipkin SM, Lowe SW, Downing JR, Altshuler D, Sandlund JT, Horwitz MS, Mullighan CG, Offit K.Nat
    Genet. 2013 Oct;45(10):1226-31. doi: 10.1038/ng.2754. Epub 2013 Sep 8.

  4. RNAi screening uncovers Dhx9 as a modifier of ABT-737 resistance in an Eμ-myc/Bcl-2 mouse model.
    Mills JR, Malina A, Lee T, Di Paola D, Larsson O, Miething C, Grosse F, Tang H, Zannis-Hadjopoulos M, Lowe SW, Pelletier J.
    Blood. 2013 Apr 25;121(17):3402-12. doi: 10.1182/blood-2012-06-434365. Epub 2013 Feb 25.

  5. Unexpected dissemination patterns in lymphoma progression revealed by serial imaging within a murine lymph node.
    Ito K, Smith BR, Parashurama N, Yoon JK, Song SY, Miething C, Mallick P, Lowe S, Gambhir SS.
    Cancer Res. 2012 Dec 1;72(23):6111-8. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-12-2579. Epub 2012 Oct 2.

  6. A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis.
    Scuoppo C, Miething C, Lindqvist L, Reyes J, Ruse C, Appelmann I, Yoon S, Krasnitz A, Teruya-Feldstein J, Pappin D, Pelletier J, Lowe SW.
    Nature. 2012 Jul 12;487(7406):244-8. doi: 10.1038/nature11126.

  7. Cks1 is required for tumor cell proliferation but not sufficient to induce hematopoietic malignancies.
    Kratzat S, Nikolova V, Miething C, Hoellein A, Schoeffmann S, Gorka O, Pietschmann E, Illert AL, Ruland J, Peschel C, Nilsson J, Duyster J, Keller U.
    PLoS One. 2012;7(5):e37433. doi: 10.1371/journal.pone.0037433. Epub 2012 May 18.

  8. A pipeline for the generation of shRNA transgenic mice.
    Dow LE, Premsrirut PK, Zuber J, Fellmann C, McJunkin K, Miething C, Park Y, Dickins RA, Hannon GJ, Lowe SW.
    Nat Protoc. 2012 Feb 2;7(2):374-93. doi: 10.1038/nprot.2011.446.

  9. An RNAi-based system for loss-of-function analysis identifies Raf1 as a crucial mediator of BCR-ABL-driven leukemogenesis.
    Albers C, Illert AL, Miething C, Leischner H, Thiede M, Peschel C, Duyster J.
    Blood. 2011 Aug 25;118(8):2200-10. doi: 10.1182/blood-2010-10-309583. Epub 2011 Jun 29.

  10. A rapid and scalable system for studying gene function in mice using conditional RNA interference.
    Premsrirut PK, Dow LE, Kim SY, Camiolo M, Malone CD, Miething C, Scuoppo C, Zuber J, Dickins RA, Kogan SC, Shroyer KR, Sordella R, Hannon GJ, Lowe SW.
    Cell. 2011 Apr 1;145(1):145-58. doi: 10.1016/j.cell.2011.03.012.

  11. Functional identification of tumor-suppressor genes through an in vivo RNA interference screen in a mouse lymphoma model.
    Bric A, Miething C, Bialucha CU, Scuoppo C, Zender L, Krasnitz A, Xuan Z, Zuber J, Wigler M, Hicks J, McCombie RW, Hemann MT, Hannon GJ, Powers S, Lowe SW.
    Cancer Cell. 2009 Oct 6;16(4):324-35. doi: 10.1016/j.ccr.2009.08.015.

  12. Imatinib and leptomycin B are effective in overcoming imatinib-resistance due to Bcr-Abl amplification and clonal evolution but not due to Bcr-Abl kinase domain mutation.
    Kancha RK, von Bubnoff N, Miething C, Peschel C, Götze KS, Duyster J.
    Haematologica. 2008 Nov;93(11):1718-22. doi: 10.3324/haematol.13207. Epub 2008 Aug 25.

  13. Senescence of activated stellate cells limits liver fibrosis.
    Krizhanovsky V, Yon M, Dickins RA, Hearn S, Simon J, Miething C, Yee H, Zender L, Lowe SW.
    Cell. 2008 Aug 22;134(4):657-67. doi: 10.1016/j.cell.2008.06.049.

  14. NF-kappaB is a negative regulator of IL-1beta secretion as revealed by genetic and pharmacological inhibition of IKKbeta.
    Greten FR, Arkan MC, Bollrath J, Hsu LC, Goode J, Miething C, Göktuna SI, Neuenhahn M, Fierer J, Paxian S, Van Rooijen N, Xu Y, O'Cain T, Jaffee BB, Busch DH, Duyster J, Schmid RM, Eckmann L, Karin M.
    Cell. 2007 Sep 7;130(5):918-31.

  15. Retroviral insertional mutagenesis identifies RUNX genes involved in chronic myeloid leukemia disease persistence under imatinib treatment.
    Miething C, Grundler R, Mugler C, Brero S, Hoepfl J, Geigl J, Speicher MR, Ottmann O, Peschel C, Duyster J.
    Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Mar 13;104(11):4594-9. Epub 2007 Mar 5.

  16. Senescence and tumour clearance is triggered by p53 restoration in murine liver carcinomas.
    Xue W, Zender L, Miething C, Dickins RA, Hernando E, Krizhanovsky V, Cordon-Cardo C, Lowe SW.
    Nature. 2007 Feb 8;445(7128):656-60. Epub 2007 Jan 24. Erratum in: Nature. 2011 May 26;473(7348):544.

  17. Targeting the oncogenic tyrosine kinase NPM-ALK in lymphoma: the role of murine models in defining pathogenesis and treatment options.
    Miething C, Peschel C, Duyster J.
    Curr Drug Targets. 2006 Oct;7(10):1329-34. Review.

Arbeitsgruppen Leiter

Dr. med. Cornelius Miething

UNIVERSITAETSKLINIKUM FREIBURG
Klinik für Innere Medizin I
Schwerpunkt Haematologie, Onkologie und Stammzelltransplantation

Hugstetter Str. 55
79106 Freiburg

ZTZ - Zentrum Translationale Zellforschung
Breisacherstr. 115
79106 Freiburg

Telefon+49 (0) 761 270-71830
Telefax+49 (0) 761 270-71770