Die Abteilung Finanzbuchhaltung und Steuern hat als Kernaufgabe die Erstellung der Jahresabschlüsse des Universitätsklinikums und der Medizinischen Fakultät. Die Abteilung unterstützt die Klinikumsleitung, die Geschäftsbereiche, die Verwaltungsreferate und die Stabsstellen in betriebswirtschaftlichen, steuerlichen und bilanziellen Fragestellungen. Ziel der Finazbuchhaltung ist die Abbildung sämtlicher Geschäftsvorfälle und Zahlungsströme des Klinikums und der Medizinischen Fakultät.