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Willkommen bei der quantitativen und prädiktiven Infektionsepidemiologie

Wir hier versuchen, die Verbreitung von Infektionskrankheiten in Zahlen zu fassen. Wir versuchen zu verstehen, wie sie sich auf diese Weise verbreiten. Anschließend entwickeln wir Strategien um die Ausbreitung von Krankheiten zu reduzieren.

Drei Themengebiete, die wir am besten beherrschen:
1) Erstens: Prognosen 
Prognosen für Epidemien und Pandemien. Unsere Gruppe ist darauf spezialisiert, Prognosen über die Ausbreitung von Infektionskrankheiten zu erstellen - auf regionaler Ebene. Für das Jahr 2022 haben wir die Anzahl der Betten abgeschätzt, die zur Behandlung von COVID-Patienten in einem einzigen Krankenhaus benötigt werden. Diese Vorhersagen halfen dem Uniklinikum bei den verschiedenen COVID-Wellen. 
2) Zweitens Netzwerke 
Jedes Mal, wenn ein Patient von einem Krankenhaus zum nächsten wechselt, besteht die Gefahr, dass er antimikrobiell resistente Bakterien von einem Krankenhaus auf das andere überträgt. Durch ihre Bewegung schaffen die Patienten ein Netzwerk. Durch die Untersuchung dieser Netzwerke können wir neue Wege finden, um eine weitere Ausbreitung zu verhindern. 
3) Drittens genetische Spuren
Die Ankunft einer neuen Variante hinterlässt ihre Spuren in der genetischen Struktur der gesamten Viruspopulation. Wir entwickeln Methoden, um diese Spuren zu "lesen" und die Parameter der Epidemie aus den Genomdaten zu schätzen. Wir nutzen die Spuren dann zur rechtzeitigen Erkennung von Ereignissen und für bessere Vorhersagen der Epidemie.

Bei allen diesen Themen haben wir viel Erfahrung mit der Entwicklung von R-Skripten, R-Paketen und R-Shiny Dashboards gesammelt, die wir gerne mit anderen teilen: Du analysierst auch Daten in R? Schau dir unser github an! 

Arbeitsgruppenleitung:

Dr. rer. nat. Tjibbe Donker

Bioinformatiker, Medizinstatistiker

Tel.: +49 (0) 761 270 82550  

Fax: +49 (0) 761 270 83030

tjibbe.donker@uniklinik-freiburg.de