Team
Prof. Dr. Dr. Melanie Börries
Tel.: 0761 270-84671
Melanie.boerries@uniklinik-freiburg.de
Miriam von Scheibner
Tel.: 0761 270-84673
miriam.scheibner@uniklinik-freiburg.de
Dr. Geoffroy Andrieux
Stellvertretung
Junior Gruppen Leiter EkoEstMed
Tel.: 0761 270-84678
geoffroy.andrieux@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- NGS-Analyse (DNAseq, RNAseq, Proteomik, Epigenetik)
- Integration von Multi-omics-Daten
- Netzwerk-Modellierung
- Identifizierung von Biomarkern
- Entwicklung von Pipelines
Affiliierung: Mitglied im MIRACUM https://www.miracum.org/das-konsortium/nachwuchsforschergruppen/ekoestmed/
Bismark Appiah
Postdoktorand
Tel.: 0761 270-84683
bismark.appiah@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- NGS analyse - scRNA-seq, RNA-seq
- Epigenetik
- Zell/Molekularbiologische Methoden
Andreas Blaumeiser
Mitglied in der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: 0761 270-84659
andreas.blaumeiser@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Pipeline-Entwicklung
Affiliierung: Mitglied im MTB, DKTK https://dktk.dkfz.de/de/home
Dr. Sajib Chakraborty
Postdoktorand
Mitglied der Nachwuchsgruppe EkoEstMed
Tel.: 0761 270-84656
sajib.chakraborty@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Bulk, Single-cell, and Spatial transcriptomics
- Proteomics and Phosphoproteomics Analysen (LC-MS/MS, DIA, DDA, SILAC, TMT, Label-free).
- Integration von Multiomics-Daten
- Systembiologie
Dr. Eyleen Corrales
Postdoktorandin
Tel.: 0761 203-9628
eyleen.corrales@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
-
NGS-Analyse (RNA-seq, ATAC-seq)
-
Zell- und molekularbiologische Methoden
-
Vorhersage der Zell-Zell-Kommunikation
Tonmoy Das
Doktorand
Mitglied der Nachwuchsgruppe EkoEstMed
Tel.: 0761 270-84664
tonmoy.das@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- NGS data analysis (WES, RNA-seq)
- Multi-omics data integration
- Pipeline development
Maria Hess
Doktorandin
Mitglied in der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: 0761 270-84680
maria.elena.hess@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- DNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung
Affiliierung: Mitglied im MTB https://www.uniklinik-freiburg.de/medizin1/behandlung/molekulares-tumorboard.html
Dr. Anselm Hoppmann
Postdoktorand
0761 270-84664
Anselm.Hoppmann@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- DNA-Sequenzierung
- Pipeline Entwicklung
- Softwareentwicklung
- Datenbanken
Affiliierung: Mitglied im MTB
Dr. Rhena Klar
Tel: +49 761 203 9628
rhena.klar@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- primäre 3D Organoidkulturen
- Zell- und molekularbiologische Methoden
Affilierung: Koordination FreezeO, DKTK https://dktk.dkfz.de/de/home
Silke Kowar
Technische Assistentin
Tel.: 0761 203-9619
silke.kowar@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- BTA
- Laborassistenz/ Labororganisation
- Molekularbiologisches Arbeiten
- PDAC/Melanom/MTB/Prudent
Christopher Krolla
Doktorand
Mitglied in der Junior Gruppe EkoEstMed
Tel.: 0761 270-846662
christopher.krolla@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Machine- und Deep Learning (Bild, Graph strukturiert, Text, Tabellarisch, Video)
- Bildverarbeitung
- NGS-Analyse (DNAseq, RNAseq, Single-Cell)
- Integration von Multi-omics-Daten
- Entwicklung von Pipelines
Ariane Lehmann
Doktorandin
Tel.: 0761 270-84679
ariane.lehmann@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Kompetenz im Labor
- RNA-Sequenzierung
- DNA-Sequenzierung
Dr. Ella Levit Zerdoun
Postdoc
Tel.: 0761 - 203 9628
ella.levit.zerdoun@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
-
Molekularbiologie
-
Zellbiologie
-
Immunbiologie
Affiliierung: Mitglied im DKTK https://dktk.dkfz.de/de/home
Nawal Madkhali
Doktorandin
Tel.: 0761 203-9619
nawal.madkhali@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Molekulare Biologie / Immunologie
- Sequenzierung der nächsten Generation
- Gene Editing
Affiliierung: Mitglied im GRAKO http://www.meinbio.uni-freiburg.de/what-is-meinbio
Ralf Mertes
Doktorand
Mitglied in der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: +49 (0) 761 270-84693
ralf.mertes@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Zell- und molekularbiologische Labormethoden
- DNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung
Affiliierung: Mitglied im MTB https://www.uniklinik-freiburg.de/medizin1/behandlung/molekulares-tumorboard.html
Dr. Patrick Metzger
Leiter der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: 0761 270-84682
patrick.metzger@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- DNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung
- Pipeline Entwicklung
Affiliierung: Mitglied im MTB, UE3 MIRACUM https://www.uniklinik-freiburg.de/medizin1/behandlung/molekulares-tumorboard.html https://www.miracum.org/
Dr. Katharina Moos
Postdoktorandin
Tel.: 0761 270-84681
katharina.moos@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- DNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung
Dr. Thomas Pauli
Postdoktorand
Mitglied in der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: 0761 270-84685
thomas.pauli@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- DNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung
Senthilkumar Ramamoorthy
Tel.: 0761 270-84674
senthilkumar.ramamoorthy@uniklinik-freiburg.de
Junior-Gruppenleiter bei Prof.Niemeyer/Ehl-Gruppe
Michael Rauer
Tel.: 0761 270-84676
michael.rauer@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Bioinformatik-Analyse von Epigenomik und Transkriptomik
- Integrative NGS-Datenanalyse
- Entwicklung von Computational Workflows
Aránzazu Sáenz
Doktorandin
Tel.: 0761 203-9619
aranzazu.saenz.espinoza@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Molekulare Biologie
- Biochemie
- Sequenzierung der nächsten Generation
Affiliierung: Mitglied im GRAKO http://www.meinbio.uni-freiburg.de/what-is-meinbio
Dr. Vincent Schipperges
Postdoktorand
Mitglied in der AG Molekulares Tumorboard
Tel.: 0761 270-84694
vincent.schipperges@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Datenanalyse
- Pipeline-Entwicklung
Affiliierung: Mitglied im SFB 1160 https://www.sfb1160.uni-freiburg.de/
Georg Vladimirov
Doktorand
Tel.: 0761 203-9619
georg.vladimirov@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Molekulare Biologie
- Molekulare Medizin
Gene Editing / RNA-Interferenz
Frederik Voigt
Tel.: 0761 270-84675
Frederik.voigt@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Datenbanken
- Schnittstellenentwicklung
Affiliierung: Mitglied im MTB, ZPM, AG Künstliche Intelligenz
Geritt Batt
Linux HPC-Cluster Administrator
Tel.: 0761 270-84687
geritt.batt@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Linux HPC
Tom Deak
Linux HPC-Cluster Administrator
Tel.: 0761 270-84684
tom.deak@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Linux HPC
Jonas Gassenschmidt
Softwareentwickler
Tel.: 0761 270-84655
jonas.gassenschmidt@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Softwareentwicklung
Georg Kohnke
Softwareentwickler
Tel.: 0761 270-84686
georg.kohnke@uniklinik-freiburg.de
Expertise:
- Software-Architektur
Lea Krömer
Tanja Werner