Institut für Infektionsprävention und Krankenhaushygiene

IIK Arbeitsgruppe Mikrobielle Genomanalyse

- Ganzgenomsequenzierung krankenhausrelevanter Pathogene -

Über uns

Wir benutzen Gesamtgenomsequenzierung als Tool, um uns anzuschauen, was ein Bakterium ausmacht. Indem wir seinen genetischen Kode auslesen, haben wir die größtmögliche Auflösung, um uns über mögliche Übertragungen auf Krankenhaus-Stationen zu informieren, was uns ermöglicht, Ausbrüche zu untersuchen. Weiterhin können wir aus den generierten Daten auch über Antibiotika-Resistenzen lernen. Wir sind in einer Anzahl von Projekten mit internen und externen Kollaborateuren involviert. Eines unserer Hauptaugenmerke liegt auf der Ausbreitung von multiresistenten Gram-negativen Klonen in Krankenhausnetzwerken. Dabei arbeiten wir eng mit Wissenschaftlern am Wellcome Trust Sanger Institute (Cambridge, UK), Big Data Institute (Oxford, UK), University Medical Center Groningen (Groningen, Niederlande), Charité Berlin (Berlin, Deutschland) und Justus-Liebig-Universitätsklinik (Gießen, Deutschland) zusammen.

Zentrale Themen

Ganzgenomsequenzierung zur Infektionsprävention und -kontrolle
Verständnis der Übertragungsdynamiken und des Einflusses der Krankenhausumgebung auf die Transmission
Entwicklung von Sequenzierungs- und Analyseverfahren für neue Herausforderungen: Plasmidübertragung, metagenomische Diagnostik

Interessensgebiet

Evolution von Bakterien im Rahmen von Gesundheitssystemen, ihre Anpassungs- und Überlebensstrategien
Genomsequenzierung als Unterstützung in der Infektionsprävention und Krankenhausepidemiologie
Rolle von Plasmiden im Infektionsgeschehen