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Institut für Genetische Epidemiologie

Curriculare Veranstaltungen

 

Der Querschnittsbereich 1 ist Teil des Kurrikulums im Studiengang Humanmedizin und besteht aus vier Teilen:

  • Ätiologie und Risiko
  • Diagnose und Prognose
  • Intervention
  • Medizinische Informatik 

Das Institut für Genetische Epidemiologie beteiligt sich an der Lehre für den QB1.

Koordination: Institut für Medizinische Biometrie und Statistik
Weitere Informationen: http://www.imbi.uni-freiburg.de/lehre
Veranstaltungsnummer: 04LE58V-EpiQB001-01

 

 

 

Der Querschnittsbereich 3 ist Teil des Kurrikulums im Studiengang Humanmedizin. Das Institut für Genetische Epidemiologie beteiligt sich an der Lehre für den QB3.

Koordination: Institut für Medizinische Biometrie und Statistik Weitere Informationen: http://www.imbi.uni-freiburg.de/lehre
Veranstaltungsnummer: 04LE57V-GÖQB003-01

Das Seminar ist Teil des Kurrikulums für Studierende im Masterstudiengang Molekularmedizin (https://www.molekularmedizin.uni-freiburg.de). Medizinische Mitarbeiter des Instituts für Genetische Epidemiologie beteiligen sich mit jeweils einer Vorlesung.

Veranstaltungsnummer: 04LE59S-MSc440

Methodische und statistische Grundlagen sind nicht nur für Promotions- und Forschungsvorhaben angehender Medizinerinnen und Medizinern relevant, sondern auch für die ärztliche Praxis, um Patientinnen und Patienten die bestmögliche Versorgung zu kommen zu lassen.

Das Pflichtseminar für Studierende des 2. Semesters Humanmedizin ist am Konzept des Team-Based-Learning orientiert und wird tutoriell unterstützt. Dozierende unterschiedlicher klinischer Fächer wie auch aus dem Bereich der Genetischen Epidemiologie stehen in Q&A Sitzungen und als Mentorinnen und Mentoren zur Verfügung.

Koordination: Medizinische Psychologie und Medizinische Soziologie Dr. Götz Fabry, Dipl.-Päd. Ariane Zeuner
Veranstaltungsnummer: 04LE57S-MPsy0215PF

Fakultative Veranstaltungen

Der Bioinformatik Club dient als Plattform für den wissenschaftlichen Austausch zwischen Forschern des Universitätsklinikums Freiburg, der Medizinischen Fakultät, der 11. Fakultät der Universität Freiburg und des Max Planck Instituts für Immunobiologie und Epigenetik, die im Bereich (medizinische) Bioinformatik und verwandter Themengebiete aus Medizin und Statistik arbeiten.

Während der monatlich stattfindenden Treffen werden Methodik, Software, analytische Herausforderungen und deren potentielle Lösungen vor allem in Bezug auf hoch-dimensionale Daten wie Genom-Sequenzen diskutiert.

Weitere Informationen zum Bioinformatik Club finden Sie hier.

Veranstaltungsnummer: 04LE58T-GenEpiS2FA

Der SFB 992 - Medical Epigenetics - organisiert diese Vorlesungsreihe. Vortragende sind renommierte Wissenschaftler aus Freiburg, Basel und München.
Die Vorlesung bildet einen wichtigen Bestandteil der Ausbildung von Doktoranden, steht aber natürlich auch Postdoc-Stipendiaten und anderen Wissenschaftlern offen. Sie kann auch für fortgeschrittene Studenten mit guten Kenntnissen in Biochemie (MSc, 3. bis 4. Jahr Diplom oder Staatsexamen) von Nutzen sein.

Die Vorträge finden im WS 2019/20 dienstags von 10:00 - 12:00 Uhr im FRIAS-Hörsaal statt und werden jedes WS wiederholt. 

Dies ist der "alte Anatomie-Hörsaal" im FRIAS-Gebäude, Albertstr. 19 


www.uni-freiburg.de/universitaet/kontakt-und-wegweiser (Gebäude Nr. 24)

Die Vorträge werden auf Englisch gehalten. 
Die Teilnahme wird von der Fakultät für Biologie als "Oberseminar" anerkannt.

Weitere Informationen zur Vorlesung finden Sie hier.

Zu Weiterbildungszwecken treffen sich Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter des Instituts für Genetische Epidemiologie sowie interessierte Studierende und Wissenschaftler jeden zweiten Dienstag um 11:30 Uhr.

Treffpunkt: Konferenzraum (R 023, Kellergeschoss), Hugstetter Str. 49

Wir freuen uns über die Teilnahme von interessierten Gästen!

Veranstaltungsnummer: 04LE58S-GenEpiS1FA

Datum

Name des Vortragenden

Thema

26/01/2021

Yurong Cheng

Untargeted high-resolution paired mass distance data mining for retrieving general chemical relationships

12/01/2021

Jan Lipovsek

Whole Body MR Imaging in Population Based Studies, especially the NAKO

15/12/2020

Ulla Schultheiß

Infection in CKD in general and within the GCKD study

17/11/2020

Peggy Sekula

The STAAR Method for Dynamic Incorporation of Multiple Functional Annotations in Whole Genome Sequencing Studies

03/11/2020

Yong Li

Omnigenic Model - Trans Effects on Gene Expression

20/10/2020

Matthias Wuttke

Phenome-Wide Association Studies

06/10/2020

Anna Köttgen​

Polygenic background modifies penetrance of monogenic variants for tier 1 genomic conditions

21/07/2020

Fruzsina Kotsis

Kidney function - new KDIGO nomenclature and estimated GFR (eGFR)

30/06/2020

Pascal Schlosser

The promise and challenge of therapeutic genome editing

23/06/2020

Yurong Cheng

The simple introduction of KTEA(Kidney Tubules Expression Atlas) and Pathview

19/05/2020

Ulla Schultheiß

Graphical presentation of confounding in directed acyclic graphs

21/04/2020

Inga Steinbrenner

Assessment of predictive ability

25/02/2020

Yong Li

Mechanisms of tissue and cell-type specificity in heritable traits and diseases

11/02/2020

Matthias Wuttke

Genome-wide rare variant analysis in large cohorts

04/02/2020

Peggy Sekula

Moving to a world beyond “p<0.05”

14/01/2020

Fruzsina Kotsis

Microbiom - an introduction

03/12/2019

Sagar (Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics)

Deciphering the Regulatory Landscape of Fetal and Adult Gamma-Delta T-cell Development by Single-cell RNA-sequencing

26/11/2019

Pascal Schlosser

Components of genetic associations across 2,138 phenotypes in the UK Biobank highlight adipocyte biology

05/11/2019

Yurong Cheng

Proteomics and Metabolomics in Kidney Disease, including Insights into Etiology, Treatment, and Prevention

22/10/2019

Ulla Schultheiß

Osteopontin - an overview​

08/10/2019

Franziska Grundner-Culemann

ACAT: A Fast and Powerful P-value Combination Method for Rare-variant Analysis in Sequencing Studies

10/09/2019

Peggy Sekula

SAIGE and SAIGE-GENE – New software for PheWAS

30/07/2019

Anna Köttgen​

A genetics-led approach to define disease-specific drug target landscapes

16/07/2019

Yong Li

Integrative Single-cell Analysis

16/07/2019

Yong Li

Integrative Single-cell Analysis

02/07/2019

Matthias Wuttke

MAGMA: Generalized Gene-Set Analysis of GWAS Data

25/06/2019

Inga Poguntke

A study paradigm integrating prospective epidemiologic cohorts and electronic health records to identify disease biomarkers

21/05/2019

Pascal Schlosser

Renal compartment–specific genetic variation analyses identify new pathways in chronic kidney disease

30/04/2019

Fruzsina Kotsis

The kidney - structure, cell types and their function

09/04/2019

Anselm Hoppmann

PhD Progress

12/03/2019

Ulla Schultheiß

CKDNapp - a toolbox for monitoring and tailoring treatment of CKD patients

26/02/2019

Yurong Cheng

Settling the score: variant prioritization and Mendelian disease

12/02/2019

Peggy Sekula

Application of Mendelian Randomization Method to Evaluate Drugs regarding their Repurposing Potential and Adverse Effect Profiles

28/01/2019

Franziska Grundner-Culemann

Estimating effect size distributions from summary statistics

15/01/2019

Anna Köttgen

Longitudinal personal DNA methylome dynamics in a human with a chronic condition

18/12/2018

Yong Li

Introduction to single cell RNA-seq data analysis

11/12/2018

Matthias Wuttke

BOLT-LMM: Efficient Bayesian mixed-model analysis in large cohorts

20/11/2018

Inga Poguntke

Genome-wide polygenic scores for common diseases identify individuals with risk equivalent to monogenic mutations

06/11/2018

Pascal Schlosser

Co-regulatory networks of human serum proteins link genetics to disease

23/10/2018

Lora Minkova

Combining brain MRI measures with DNA methylation for predicting cognitive impairment

09/10/2018

Ulla Schultheiß

NAKO - Germany's largest health study: An introduction

11/09/2018

Yurong Cheng

Uromodulin: from monogenic to multifactorial diseases

07/08/2018

Peggy Sekula

Tests-Errors-Power - 1) Repetition for non-Stats: Tests and Errors, 2) Power calculation for survival endpoints

30/07/2018

Franziska Grundner-Culemann

Colocalization methods

17/07/2018

Yong Li

Basic introduction to Circos plot

03/07/2018

Matthias Wuttke

Heritability enrichment of specifically expressed genes identifies disease-relevant tissues and cell types

19/06/2018

Martin Treppner(Invited Speaker)

How to use t-SNE effectively

05/06/2018

Inga Poguntke

Competing risk analyses – what to do and what to report?

15/05/2018

Pascal Schlosser

Teschendorff 2018, Review: Statistical and integrative system-level analysis of DNA methylation data.

24/04/2018

Ulla Schultheiß

Gout - etiology, pathogenesis, clinical presentation, diagnostics and therapy

10/04/2018

Anna Köttgen

An Introduction of the NephQTL Browser

13/03/2018

Yurong Cheng

Fine Mapping and Functional Analysis Reveal a Role of SLC22A1 in Acylcarnitine Transport

27/02/2018

Anselm Hoppmann

Variant Effect Prediciton Tools

13/02/2018

Franziska Grundner-Culemann

Methylation-Overview + EPIC array + CPACOR

30/01/2018

Svetlana Rylova (Invited Speaker)

Targeting Anti TGF Therapy to Fibrotic Kidneys with a Dual Specificity Antibody Approach

16/01/2018

Peggy Sekula

Splines

19/12/2017

Yong Li

Metabolomics Workflows - Notes from an EBI Course

12/12/2017

Matthias Wuttke

Conditional and joint multiple-SNP analysis of GWAS summary statistics

21/11/2017

Inga Poguntke

The Cox model - when and how to use it

07/11/2017

Ulla Schultheiß

End points and biomarkers in GCKD

24/10/2017

Svetlana Rylova (Invited Speaker)

Targeted therapies in lung cancer

10/10/2017

Pascal Schlosser

International Human Epigenome Consortium: An Overview

26/09/2017

Anselm Hoppmann

Settling the score on variant prioritization in mendelian disease

25/07/2017

Peggy Sekula

MR-MEGA (Meta Analysis)

18/07/2017

Yong Li

Genotype-covariate interaction effects and the heritability of adult body mass index

11/07/2017

Matthias Wuttke

Omnigenic Model // "An Expanded View of Complex Traits: From Polygenic to Omnigenic"

27/06/2017

Jiaojiao Jing

The genotype-tissue expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans

30/05/2017

Anna Köttgen

Integration of GWAS and eQTL datasets to predict disease genes: Summary data-based Mendelian Randomization (SMR) method

09/05/2017

Pascal Schlosser

Imputation for Metabolomics

11/04/2017

Anselm Hoppmann

The human gene damage index as gene-level approach to prioritizing exome variants

28/03/2017

Peggy Sekula

Population genetics - some basic concepts

14/03/2017

Yong Li

Dissecting the genetics of complex traits using summary association statistics

07/03/2017

Jiaojiao Jing

Analysis of protein complexes using mass spectrometry

14/02/2017

Ulla Schultheiss

GCKD variables - featuring the inventory

In dieser Veranstaltung wird der Rahmen geschaffen, in dem ForscherInnen Ihre Arbeiten aus dem Bereich der Genetischen Epidemiologie in Kurzvorträgen vorstellen und das weitere Vorgehen absprechen können. Pro Termin wird jeweils ein Projekt detailliert besprochen. Spezialthemen, die für die gesamte Gruppen von Interesse sind, werden wöchentlich diskutiert.

Anmeldung: Teilnahme nur nach persönlicher Anmeldung im Institutssekretariat (bemb.ge.info@uniklinik-freiburg.de).
Veranstaltungsnummer: 04LE58S-GenEpiS3FA

Im Rahmen des Seminars werden v.a. epidemiologische und statistische Methoden zur Erforschung der Ätiologie humaner renaler und metabolischer Erkrankungen, ihrer Häufigkeit und ihren Folgen besprochen und bezüglich ihrer Limitationen diskutiert. Die Grundlage für diese Veranstaltung bildet eine Reihe von wissenschaftlichen Publikationen sowie die Präsentation eigener Projekte der Teilnehmenden.

Anmeldung: Teilnahme nur nach persönlicher Anmeldung im Institutssekretariat (bemb.ge.info@uniklinik-freiburg.de).
Veranstaltungsnummer: 04LE58S-GenEpiS4FA

Seminar bietet die Gelegenheit, am Institut laufende und eigenständig erarbeitete Projekte im Bereich der Auswertung von metabolomischen Daten und deren Integration mit anderen –Omics-Daten vorzustellen. Gemeinsam werden Probleme und Lösungsansätze besprochen bzw. die daraus resultierenden Lösungen und Ergebnisse (Fortschritt) vorgestellt.

Anmeldung: Teilnahme nur nach persönlicher Anmeldung im Institutssekretariat (bemb.ge.info@uniklinik-freiburg.de).
Veranstaltungsnummer: 04LE58S-GenEpiS5FA

MentoMed ist ein Mentoring-Programm für Medizinstudierende des 2. Studienabschnitts der Universtität Freiburg, das im Jahr 2014 initialisiert wurde. Studierende werden je nach Fachrichtungswunsch durch ein One-to-One- oder durch ein Gruppen-Mentoring über zwei Semester von einem Mentor begleitet. Die Mentoren sind Personen mit einem abgeschlossenen Medizinstudium, die entweder als Arzt und/oder in der Forschung tätig sind.

Ziel ist es, dass innerhalb von vier bis sechs Treffen den Studierenden ein umfangreicher Einblick in die Arbeit des Mentors/der Mentorin sowie seines/ihres Berufsweges gegeben wird und alle Fragen zu Themen, die die Studierenden interessieren, beantwortet werden. Besprochene Themen sind hierbei sehr divers und beinhalten unter anderem: Karriereplanung, Doktorarbeit, Famulaturen, PJ, Familie und Beruf, etc.

Dieses Vorhaben wird aus Mitteln des Bundesministeriums für Bildung und Forschung unter den Förderkennzeichen 01PL16007 und 01JA1518A gefördert.

Das Institut für Genetische Epidemiologie unterstützt dieses Vorhaben.

Weitere Informationen: www.mentomed.uni-freiburg.de/index.php/startseite.html