Medical Data Science
| Dozent: | Prof. Dr. Harald Binder |
| Beginn: | Mittwoch, 14.10.2026 |
| Ende: | Mittwoch, 03.02.2027 |
| Uhrzeit: | 10:15 - 11:30 Uhr s.t. |
| Ort: | Hörsaal IMBI Institut für Medizinische Biometrie und Statistik (1. OG, Stefan-Meier-Straße 26) |
| VLVZ: | 07LE23S-Sem-8-Bi |
| Vorbesprechung: | 22.07.2026 Vorherige Anmeldung per E-Mail (bemb.imbi.sek@list.uniklinik-freiburg.de) ist erwünscht. |
Inhalt:
Zur Beantwortung komplexer biomedizinischer Fragestellungen aus großen Datenmengen ist oft ein breites Spektrum an Analysewerkzeugen notwendig, z.B. Deep Learning- oder allgemeiner Machine Learning-Techniken, was häufig unter dem Begriff "Medical Data Science" zusammengefasst wird. Statistische Ansätze spielen eine wesentliche Rolle als Basis dafür. Eine Auswahl von Ansätzen soll in den Seminarvorträgen vorgestellt werden, die sich an kürzlich erschienenen Originalarbeiten orientieren. Die genaue thematische Ausrichtung wird noch festgelegt. Zu Beginn des Seminars werden ein oder zwei Übersichtsvorträge stehen, die als vertiefende Einführung in die Thematik dienen.
| Termin | Vortragende(r) | Thema / Artikel |
| 21.10.2026 | Jakob Kailer | Fraser-Taliente et al. (2026). Natural language autoencoders produce unsupervised explanations of LLM activations. transformer-circuits.pub/2026/nla/index.html |
| 28.10.2026 | Joachim Nguyen | Romanou et al. (2026). Brittlebench: Quantifying LLM robustness via prompt sensitivity. arxiv.org/abs/2603.13285 |
| 04.11.2026 | Roana Malsch | Gloaguen et al. (2026). Evaluating AGENTS.md: Are repository-level context files helpful for coding agents? arxiv.org/abs/2602.11988 |
| 11.11.2026 | Simon Reiser | Rabanser et al. (2026). Towards a science of AI agent reliability. arxiv.org/pdf/2602.16666 |
| 18.11.2026 | Tede Utzny | Hans and Bilinois (2026). Coding-agents can replicate scientific machine learning papers. arxiv.org/pdf/2607.02134 |
| 25.11.2026 (start at 10:00) | Sarah Wolff, Janis Elenschleger | Gottweis et al. (2026). Accelerating scientific discovery with Co- Scientist. www.nature.com/articles/s41586-026-10644-y |
| 02.12.2026 | Jingxian Lei | Fa et al. (2026). BioAgent bench: An AI agent evaluation suite for bioinformatics. arxiv.org/pdf/2601.21800 |
| 09.12.2026 | Qianyao Zheng | Alber et al. (2026). CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data. www.nature.com/articles/s41592-026-03029-6 |
| 13.01.2027 (start at 10:00) | Yaxuan Jiang, Yu-hsuan Tung | Aygün et al. (2026). An AI system to help scientists write expert-level empirical software. www.nature.com/articles/s41586-026-10658-6 |
| 20.01.2027 | Paula Dinse | Papamarkou et al. (2026). Bayesian control for coding agents. arxiv.org/abs/2606.24453 |
| 03.02.2027 | Pei-Chun Shih | Tang et al. (2026). CellForge: Agentic design of virtual cell models. arxiv.org/pdf/2508.02276 |
| 11.02.2027 | Yujia Liu | Brunn et al. (2026). Coding agents author interpretable singlecell embedding models from the literature. www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.737048v1.abstract |
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