Organoid-Biobank
(FREEZE-O)
Organoid Biobank (FREEZE-O)
Die Nutzung von 3D Organoid Modellen gewinnt in der wissenschaftlichen Forschung als Alternative zur klassischen hochartifiziellen 2D Zellkultur zunehmend an Stellenwert. Insbesondere Organoide humanen Ursprungs sind mittlerweile essenzieller Bestandteil patientenorientierter Grundlagen- sowie translationaler Forschung. Eine Optimierung und Standardisierung der Isolation, Kultivierung und Charakterisierung humaner (Tumor-) Organoide ist von großer Notwendigkeit um das Potenzial von humaner 3D-Zellkultur zur Nutzung nicht nur in der Forschung, sondern auch in der Prävention und Diagnostik weiter zu erhöhen. Die Biobank für humane Organoide ist als Bioprobensammlung konzeptualisiert, die das Forschern am Universitätsklinikum Freiburg ermöglichen soll auf standardisiert prozessierte humane (Tumor)organoide großer Bandbreite zuzugreifen.
Konzept und Zielsetzung der Biobank für humane Organoide
Die Biobank für humane (Tumor) Organoide stellt einen neuen Knotenpunkt an der Universitätsklinik Freiburg dar, in dem aus humanem Gewebe (Biopsien / Resektaten) von Patienten mit Tumorerkrankungen Organoide mittels standardisierter Methoden isoliert, katalogisiert, kultiviert, charakterisiert und zur weiteren Verwendung durch Forscher eingefroren werden.
Nach Entnahme der Proben durch den Arzt werden durch geschultes wissenschaftliches Personal in der primären Zellkultur Organoide isoliert und kultiviert. Bei erfolgreichem Anwachsen werden die Organoide kultiviert und mikroskopisch (Hellfeldfotografie), histologisch (z.B. HE-Färbung), die Anwesenheit von Tumorzellen und mittels Flow-Cytometry (Lebend-Tot-Zellfärbung) charakterisiert. Anschließend werden die organoide zur weiteren Verwendung eingefroren.
Die Biobank für humane (Tumor) Organoide wird so strukturiert werden, dass sie institutsübergreifend allen Wissenschaftlern Zugriff auf etablierte und standardisierte Methoden zur Kultivierung humaner Organoide sowie auf humanes Material für ihre jeweiligen wissenschaftlichen Fragestellungen ermöglicht. Diese Zusammenführung der vorhandenen Kompetenzen im Bereich der Organoid Zellkultur soll langfristig einen wissenschaftlichen Mehrwert für alle mit humanen (Tumor)organoiden arbeitenden Forschenden am Universitätsklinikum bieten.
Struktur und Serviceleistungen der Biobank für humane Organoide
Nach erfolgreicher Aufklärung des Patienten und Information der Verfügbarkeit von Proben nach Resektion durch den behandelnden Arzt werden die humanen Gewebeproben von Labormitarbeitern der Biobank abgeholt, prozessiert und in Kultur genommen. Die Prozessierung der Proben erfolgt zunächst in der Primärzellkultur. Es erfolgt eine primäre Katalogisierung durch Mitarbeiter der Biobank analog den Datenschutzkonzepten der Biobank.
Charakterisierte und vermehrbare Organoide werden in Zusammenarbeit mit der "FREEZE" Biobank-Core Facility des Universitätsklinikums Freiburg final und für die weitere Distribution katalogisiert und in gefrorenem Zustand gelagert. Die Distribution an Wissenschaftler erfolgt ebenfalls in Zusammenarbeit mit der "FREEZE" Biobank-Core Facilitiy.
Benutzeranmeldung Protokolle
September 2024 - FreezeO Organoid Biobank Continues to Grow
The FreezeO Organoid Biobank is expanding rapidly, both in the number of patient-derived organoids (PDOs) in the collection and in our network of collaborative partners. This growth is largely due to the strong collaboration with various interested research groups of the Uniklinik and University Freiburg and the fantastic teamwork with the FREEZE Biobank.
A major focus of our work remains our translational approach: "From Bedside to Bench and Back".
The biobank’s „From Bedside to Bench and back“ approach is already yielding remarkable results. A notable example of this approach involves the patient-derived organoids (PDOs) from a colorectal cancer patient’s lung metastasis. These PDOs were cultivated by the FreezeO Core team and used to test targeted therapies proposed by the team of the Molecular Tumor Board (MTB). One combination stood out: a triple therapy using EGFR, BRAF, and MEK inhibitors. With support from our PDO data, and thanks to the efforts of the dedicated oncologists and the MTB team, this combination therapy was successfully approved by the patient’s insurance, and the patient has already received the first cycles, demonstrating a perfect example of translation.
Remarkably, despite the patient’s significantly deteriorated condition, the latest staging showed partial remission of both the pulmonary and thoracic lymph node metastases after just three doses of Cetuximab (EGFRi), Encorafenib (BRAFi), and Binimetinib (MEKi).
For questions or collaboration requests, please contact: freezeO@uniklinik-freiburg.de
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